Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
INCENPQ9NQS7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INCENPQ9NQS7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms