Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCRT2Q9NQ03 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCRT2Q9NQ03 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SCRT2Q9NQ03 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCRT2Q9NQ03 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCRT2Q9NQ03 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCRT2Q9NQ03 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCRT2Q9NQ03 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms