Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALMDQ9NP74 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALMDQ9NP74 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms