Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LIN28AQ9H9Z2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LIN28AQ9H9Z2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIN28AQ9H9Z2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms