Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9H4

VPS37B, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37BQ9H9H4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS37BQ9H9H4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VPS37BQ9H9H4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS37BQ9H9H4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms