Protein–RNA interactions for Protein: Q9H987

SYNPO2L, Synaptopodin 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2LQ9H987 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNPO2LQ9H987 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNPO2LQ9H987 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms