Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP4Q9H6H4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REEP4Q9H6H4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REEP4Q9H6H4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms