Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDCL3Q9H2J4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCL3Q9H2J4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms