Protein–RNA interactions for Protein: Q9H254

SPTBN4, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN4Q9H254 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTBN4Q9H254 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBN4Q9H254 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBN4Q9H254 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms