Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF3Q9H094 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NBPF3Q9H094 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NBPF3Q9H094 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms