Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LSG1Q9H089 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LSG1Q9H089 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms