Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM4Q9C037 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM4Q9C037 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms