Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PUS3Q9BZE2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PUS3Q9BZE2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PUS3Q9BZE2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms