Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PARD6BQ9BYG5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARD6BQ9BYG5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms