Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTDSS2Q9BVG9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTDSS2Q9BVG9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTDSS2Q9BVG9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms