Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TXNDC17Q9BRA2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TXNDC17Q9BRA2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TXNDC17Q9BRA2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms