Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EBF4Q9BQW3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EBF4Q9BQW3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBF4Q9BQW3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms