Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RBM4BQ9BQ04 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBM4BQ9BQ04 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms