Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPAS2Q99743 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPAS2Q99743 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms