Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LGMNQ99538 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGMNQ99538 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LGMNQ99538 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms