Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX18Q96RF0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX18Q96RF0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX18Q96RF0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms