Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC38A2Q96QD8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC38A2Q96QD8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A2Q96QD8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms