Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNMA5Q96PV4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PNMA5Q96PV4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA5Q96PV4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms