Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZIM3Q96PE6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIM3Q96PE6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIM3Q96PE6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms