Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGAP3Q96P47 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGAP3Q96P47 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms