Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS1

YPEL4, Protein yippee-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YPEL4Q96NS1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YPEL4Q96NS1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YPEL4Q96NS1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YPEL4Q96NS1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YPEL4Q96NS1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YPEL4Q96NS1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YPEL4Q96NS1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YPEL4Q96NS1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YPEL4Q96NS1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YPEL4Q96NS1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YPEL4Q96NS1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YPEL4Q96NS1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
YPEL4Q96NS1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YPEL4Q96NS1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
YPEL4Q96NS1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
YPEL4Q96NS1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
YPEL4Q96NS1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms