Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NSMCE3Q96MG7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSMCE3Q96MG7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms