Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EDC3Q96F86 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EDC3Q96F86 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC3Q96F86 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms