Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC11Q96DB2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC11Q96DB2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC11Q96DB2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms