Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFT1Q96AA3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFT1Q96AA3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFT1Q96AA3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFT1Q96AA3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFT1Q96AA3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RFT1Q96AA3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFT1Q96AA3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFT1Q96AA3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFT1Q96AA3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RFT1Q96AA3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFT1Q96AA3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFT1Q96AA3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFT1Q96AA3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFT1Q96AA3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RFT1Q96AA3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms