Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC10Q969S8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDAC10Q969S8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC10Q969S8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms