Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMBR1Q8WVP7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMBR1Q8WVP7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMBR1Q8WVP7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LMBR1Q8WVP7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms