Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF128Q8TEB7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF128Q8TEB7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF128Q8TEB7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms