Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI29

FBXO27, F-box only protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO27Q8NI29 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO27Q8NI29 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO27Q8NI29 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO27Q8NI29 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO27Q8NI29 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO27Q8NI29 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO27Q8NI29 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO27Q8NI29 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO27Q8NI29 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO27Q8NI29 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FBXO27Q8NI29 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO27Q8NI29 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms