Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHLHE22Q8NFJ8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHE22Q8NFJ8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms