Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP43Q8NFH3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP43Q8NFH3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP43Q8NFH3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms