Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPC24Q8NBT2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPC24Q8NBT2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms