Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AMER3Q8N944 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AMER3Q8N944 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AMER3Q8N944 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms