Protein–RNA interactions for Protein: Q8N715

CCDC185, Coiled-coil domain-containing protein 185, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC185Q8N715 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC185Q8N715 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC185Q8N715 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC185Q8N715 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms