Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN12Q8IYM2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN12Q8IYM2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN12Q8IYM2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN12Q8IYM2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN12Q8IYM2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN12Q8IYM2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN12Q8IYM2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLFN12Q8IYM2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLFN12Q8IYM2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLFN12Q8IYM2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms