Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC6Q8IVU3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HERC6Q8IVU3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC6Q8IVU3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms