Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC50Q8IVM0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC50Q8IVM0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC50Q8IVM0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC50Q8IVM0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms