Protein–RNA interactions for Protein: Q86YJ5

MARCH9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH9Q86YJ5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH9Q86YJ5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH9Q86YJ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms