Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPFIBP1Q86W92 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PPFIBP1Q86W92 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PPFIBP1Q86W92 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PPFIBP1Q86W92 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms