Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPF39Q86UA1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPF39Q86UA1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms