Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYT9Q86SS6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYT9Q86SS6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYT9Q86SS6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYT9Q86SS6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYT9Q86SS6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYT9Q86SS6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYT9Q86SS6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYT9Q86SS6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms