Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC80Q76M96 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC80Q76M96 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms