Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SRCAPQ6ZRS2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SRCAPQ6ZRS2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
SRCAPQ6ZRS2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SRCAPQ6ZRS2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms