Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK4Q6UW60 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCSK4Q6UW60 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCSK4Q6UW60 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms