Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF549Q6P9A3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF549Q6P9A3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF549Q6P9A3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms